También podría mantener su header.php limpio e insertar la cuña del archivo functions.php.
// add ie conditional html5 shim to header
function add_ie_html5_shim () {
echo '<!--[if lt IE 9]>';
echo '<script src="http://html5shim.googlecode.com/svn/trunk/html5.js"></script>';
echo '<![endif]-->';
}
add_action('wp_head', 'add_ie_html5_shim');
El shim es permitir que los elementos HTML5 puedan diseñarse a través de CSS en versiones de Internet Explorer anteriores a la 9.